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模擬計算服務

模擬計算服務提供分子動力學、量子化學、有限元分析等計算方法，助力材料研究與制造設計。

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熱搜產品: 分子動力學-分子對接生物信息學-網絡藥理學分子動力學-NEMD方法對材料的熱導率計算分子動力學-電池電解液溶劑化結構

一種在計算機中模擬原子和分子運動規律的計算方法。它通過建立原子之間相互作用的物理模型（力場），根據牛頓第二定律，數值求解每個原子隨時間演化的運動軌跡。機”，能夠在飛秒到微秒甚至更長的時間尺度上，分析分子如何運動、如何相互作用、如何折疊、如何組裝，從而揭示材料性質和生物過程的動態本質。

應用領域：

1. 生物醫藥與藥物設計：研究蛋白質折疊/構象變化、藥物-靶標相互作用（結合自由能、結合模式）、膜蛋白與細胞膜相互作用、核酸動力學、藥物遞送系統自組裝。

2. 材料科學與納米技術：研究高分子材料的構象、玻璃化轉變、結晶過程；模擬復合材料界面相互作用；研究電池電解質的離子輸運、納米流體限域效應。

3. 化學化工與催化：研究溶液化學（離子水合、質子轉移）、界面化學（吸附行為）、探索溶液或酶環境中的反應機理。

計算性質：

1. 體系構建與平衡模擬：構建復雜生物/材料體系模型；能量最小化；在指定系綜下進行平衡模擬。

2. 動力學軌跡分析與性質預測：計算結構穩定性指標；分析氫鍵等非共價相互作用；計算擴散系數、光譜性質等。

3. 熱力學與自由能計算：采用MM/PBSA等方法估算結合自由能；應用自由能微擾進行高精度計算；通過傘形采樣計算潛在平均力。

4. 增強采樣與稀有事件模擬：使用副本交換等方法加速構象空間探索；使用弦方法識別稀有事件路徑。

計算軟件：

1. GROMACS：開源，生物分子模擬領域應用最廣，計算速度極快，并行效率高。

2. AMBER：商業套件，生物體系模擬行業標準之一，力場強大，擅長自由能計算和藥物設計。

3. NAMD：開源，專為大規模并行計算設計，擅長超百萬原子的巨型生物體系。

4. LAMMPS：開源、高度模塊化，在材料科學領域占統治地位，支持原子到介觀多種模型。

5. CHARMM：老牌商業/開源軟件，力場嚴謹，在膜蛋白、糖類模擬有特色。

6. DESMOND：商業軟件，集成于Schr?dinger平臺，界面友好，與藥物發現流程銜接好。

7. 輔助與專用軟件：VMD（可視化分析），PyMOL/ChimeraX（可視化），PLUMED（增強采樣插件），MDAnalysis（分析庫）。

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成都計算狗數據科技有限公司（以下簡稱“計算狗”）作為一家為高校、研究院所和企業提供專業高效模擬計算技術支持服務的公司，既有博士領銜的985碩士起步全職技術團隊，也有經驗豐富的國內外專家組提供技術支持。計算狗可提供多尺度模擬計算解決方案，從微觀量子化學、第一性原理、分子動力學到宏觀的有限元仿真均可提供，計算服務能力專業高效，數據質量真實嚴謹，踐行用知識服務產業的使命，助力社會創新升級。已為清華、北大、川大、上交、華為海思、韓國成均館大學、瑞典皇家理工、香港理工等36萬余用戶提供超62萬次科研服務，累計完成400多萬課題，并與數千家科研院所與高校保持長期合作。我們的計算+實驗合作案例在Nature,Nat.Mater.,Nat.Catal.,J.Am.Chem.Soc.,Angew.Chem.Int.Ed.,NatCommun.,Adv.Mater.等頂級期刊均有發表，客戶復購率達94%。

岑望來

副研究員/碩士生導師畢業于四川大學，計算GO高級技術顧問

岑望來 /計算GO高級技術顧問

副研究員/碩士生導師

四川大學

研究領域:

多尺度分子模擬技術與實驗設計結合技術，系統構建納米材料、高分子材料、生物醫藥等領域中復雜界面的分子界面結構信息、分子間作用關系，擬發展功能性界面構-效關系譜。

發表文章:

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劉嵚

博士畢業于武漢大學，計算GO高級工程師

劉嵚 /計算GO高級工程師

博士

武漢大學

研究領域:

表面化學，結構力學，光催化等方面的第一性原理模擬計算。

發表文章:

ChemPhysChem, Materials Today Communications, Physical Chemistry Chemical Physics, Journal of Physical Chemistry C, Applied Surface Science等。

宋先雨

博士畢業于華中理工大學，計算GO高級工程師

宋先雨 /計算GO高級工程師

博士

華中理工大學

研究領域:

發表文章:

Macromolecules，Journal of Materials Chemistry A，Chemical Engineering Science，Journal of Physical Chemistry C，Langmuir等。

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